יישום של יודומתאן

1. משמש כריאגנט מתילציה.
2. הוצע בעבר כמרכיב של קוטלי פטריות, קוטלי עשבים, קוטלי חרקים או קוטלי נמטיות, ומטפי כיבוי.
3. משמש כחומר לחיטוי אדמה וכתחליף לברומומתאן (אסור באמנת מונטריאול).
4. משמש ברפואה, סינתזה אורגנית, בדיקת פירידין, בדיקה מיקרוסקופית וכו'.